Protein–RNA interactions for Protein: O08543

Efna5, Ephrin-A5, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna5O08543 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Efna5O08543 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Efna5O08543 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Efna5O08543 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Efna5O08543 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Efna5O08543 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Efna5O08543 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Efna5O08543 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms