Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Cldn34c3J3QJW5 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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