Protein–RNA interactions for Protein: H3BIW7

Gm29394, Predicted gene 29394, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29394H3BIW7 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm29394H3BIW7 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm29394H3BIW7 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm29394H3BIW7 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm29394H3BIW7 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm29394H3BIW7 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm29394H3BIW7 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm29394H3BIW7 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm29394H3BIW7 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm29394H3BIW7 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm29394H3BIW7 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm29394H3BIW7 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm29394H3BIW7 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm29394H3BIW7 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm29394H3BIW7 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm29394H3BIW7 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm29394H3BIW7 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm29394H3BIW7 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm29394H3BIW7 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm29394H3BIW7 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm29394H3BIW7 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm29394H3BIW7 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm29394H3BIW7 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm29394H3BIW7 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm29394H3BIW7 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm29394H3BIW7 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm29394H3BIW7 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm29394H3BIW7 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm29394H3BIW7 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm29394H3BIW7 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm29394H3BIW7 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm29394H3BIW7 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm29394H3BIW7 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm29394H3BIW7 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm29394H3BIW7 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm29394H3BIW7 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm29394H3BIW7 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm29394H3BIW7 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm29394H3BIW7 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm29394H3BIW7 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm29394H3BIW7 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm29394H3BIW7 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm29394H3BIW7 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm29394H3BIW7 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm29394H3BIW7 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm29394H3BIW7 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm29394H3BIW7 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm29394H3BIW7 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm29394H3BIW7 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm29394H3BIW7 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm29394H3BIW7 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm29394H3BIW7 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm29394H3BIW7 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm29394H3BIW7 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm29394H3BIW7 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm29394H3BIW7 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm29394H3BIW7 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm29394H3BIW7 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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