Protein–RNA interactions for Protein: G3UW71

Vmn1r167, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r167G3UW71 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vmn1r167G3UW71 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Vmn1r167G3UW71 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Vmn1r167G3UW71 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vmn1r167G3UW71 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Vmn1r167G3UW71 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Vmn1r167G3UW71 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vmn1r167G3UW71 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vmn1r167G3UW71 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vmn1r167G3UW71 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vmn1r167G3UW71 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vmn1r167G3UW71 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Vmn1r167G3UW71 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vmn1r167G3UW71 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vmn1r167G3UW71 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vmn1r167G3UW71 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vmn1r167G3UW71 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vmn1r167G3UW71 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vmn1r167G3UW71 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vmn1r167G3UW71 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vmn1r167G3UW71 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vmn1r167G3UW71 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Vmn1r167G3UW71 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vmn1r167G3UW71 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vmn1r167G3UW71 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Vmn1r167G3UW71 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vmn1r167G3UW71 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vmn1r167G3UW71 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Vmn1r167G3UW71 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Vmn1r167G3UW71 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Vmn1r167G3UW71 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Vmn1r167G3UW71 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Vmn1r167G3UW71 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Vmn1r167G3UW71 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Vmn1r167G3UW71 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Vmn1r167G3UW71 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Vmn1r167G3UW71 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vmn1r167G3UW71 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vmn1r167G3UW71 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vmn1r167G3UW71 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vmn1r167G3UW71 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vmn1r167G3UW71 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Vmn1r167G3UW71 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vmn1r167G3UW71 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Vmn1r167G3UW71 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Vmn1r167G3UW71 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vmn1r167G3UW71 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vmn1r167G3UW71 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vmn1r167G3UW71 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Vmn1r167G3UW71 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vmn1r167G3UW71 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vmn1r167G3UW71 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vmn1r167G3UW71 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vmn1r167G3UW71 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vmn1r167G3UW71 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vmn1r167G3UW71 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vmn1r167G3UW71 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vmn1r167G3UW71 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vmn1r167G3UW71 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vmn1r167G3UW71 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Vmn1r167G3UW71 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vmn1r167G3UW71 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vmn1r167G3UW71 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vmn1r167G3UW71 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vmn1r167G3UW71 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vmn1r167G3UW71 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vmn1r167G3UW71 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vmn1r167G3UW71 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vmn1r167G3UW71 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vmn1r167G3UW71 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vmn1r167G3UW71 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vmn1r167G3UW71 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vmn1r167G3UW71 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vmn1r167G3UW71 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vmn1r167G3UW71 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vmn1r167G3UW71 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vmn1r167G3UW71 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vmn1r167G3UW71 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Vmn1r167G3UW71 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vmn1r167G3UW71 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vmn1r167G3UW71 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vmn1r167G3UW71 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vmn1r167G3UW71 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vmn1r167G3UW71 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vmn1r167G3UW71 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Vmn1r167G3UW71 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Vmn1r167G3UW71 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vmn1r167G3UW71 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vmn1r167G3UW71 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Vmn1r167G3UW71 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Vmn1r167G3UW71 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Vmn1r167G3UW71 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Vmn1r167G3UW71 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vmn1r167G3UW71 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vmn1r167G3UW71 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Vmn1r167G3UW71 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vmn1r167G3UW71 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vmn1r167G3UW71 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vmn1r167G3UW71 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vmn1r167G3UW71 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.6 ms