Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Gm15271-201ENSMUST00000134627 2110 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Gm28038F7BCN9 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Gm28038F7BCN9 Gm16107-201ENSMUST00000162523 862 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
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Gm28038F7BCN9 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Gm28038F7BCN9 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
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Gm28038F7BCN9 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Gm28038F7BCN9 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Gm28038F7BCN9 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Gm28038F7BCN9 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Gm28038F7BCN9 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Gm28038F7BCN9 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Gm28038F7BCN9 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Gm28038F7BCN9 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Gm28038F7BCN9 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Gm28038F7BCN9 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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