Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Kir3dl2-201ENSMUST00000072125 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Tmem126b-201ENSMUST00000032843 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Hivep3-209ENSMUST00000166542 7253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Kif1b-203ENSMUST00000060537 10233 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Rcan2-201ENSMUST00000044792 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Pex26-203ENSMUST00000120066 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Htr1d-203ENSMUST00000121571 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Gal3st2b-202ENSMUST00000178757 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Zcchc12-202ENSMUST00000115256 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 4932431P20Rik-202ENSMUST00000141713 9288 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Cgnl1-201ENSMUST00000072899 6754 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Klhdc7a-201ENSMUST00000105031 7807 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Gm20682-201ENSMUST00000176552 3517 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Srgap3-203ENSMUST00000113169 8300 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Tank-203ENSMUST00000112495 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Inhbe-201ENSMUST00000059718 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Ralgps1-201ENSMUST00000042615 6029 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Mre11a-201ENSMUST00000034405 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Helz-201ENSMUST00000075012 6218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Gm37389-201ENSMUST00000194885 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Fam83c-201ENSMUST00000029143 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 AC131029.1-201ENSMUST00000226391 2929 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Tmem74bos-202ENSMUST00000149319 2090 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Nup214-201ENSMUST00000065398 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Ncapd3-202ENSMUST00000086198 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Ifih1-201ENSMUST00000028259 5470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Ehmt1-210ENSMUST00000147147 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Gli3-201ENSMUST00000110510 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Actbl2-201ENSMUST00000054716 2737 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Tenm1-201ENSMUST00000016294 8365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Dhx34-207ENSMUST00000163968 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Emc1-202ENSMUST00000082262 6226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms