Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M3

Gm3250, Predicted gene 3250, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3250E9Q1M3 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Gm43980-201ENSMUST00000204899 1612 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Gm13339-201ENSMUST00000120651 510 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Cgrrf1-203ENSMUST00000133989 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Gm12088-201ENSMUST00000137364 520 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Gm22885-201ENSMUST00000157410 107 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Gm2012-202ENSMUST00000163263 892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Gm26871-204ENSMUST00000181310 523 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Gm20837-202ENSMUST00000190558 844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 AC161426.1-201ENSMUST00000214137 286 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Gm39526-201ENSMUST00000208925 1413 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm3250E9Q1M3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm3250E9Q1M3 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm3250E9Q1M3 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm3250E9Q1M3 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm3250E9Q1M3 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm3250E9Q1M3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm3250E9Q1M3 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm3250E9Q1M3 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm3250E9Q1M3 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm3250E9Q1M3 Aebp2-205ENSMUST00000160836 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm3250E9Q1M3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm3250E9Q1M3 AC100590.1-201ENSMUST00000220318 1357 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm3250E9Q1M3 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm3250E9Q1M3 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm3250E9Q1M3 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm3250E9Q1M3 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm3250E9Q1M3 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm3250E9Q1M3 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm3250E9Q1M3 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm3250E9Q1M3 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm3250E9Q1M3 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm3250E9Q1M3 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm3250E9Q1M3 Arhgef38-204ENSMUST00000161932 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm3250E9Q1M3 Gm5656-201ENSMUST00000171020 1096 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm3250E9Q1M3 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm3250E9Q1M3 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm3250E9Q1M3 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm3250E9Q1M3 Gm18382-201ENSMUST00000194394 582 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm3250E9Q1M3 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm3250E9Q1M3 Gm21190-202ENSMUST00000196384 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm3250E9Q1M3 Olfr241-ps1-201ENSMUST00000197024 633 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm3250E9Q1M3 Gm21149-201ENSMUST00000197995 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm3250E9Q1M3 Gm40653-202ENSMUST00000222122 1155 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm3250E9Q1M3 Gngt1-201ENSMUST00000031673 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm3250E9Q1M3 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm3250E9Q1M3 Tas2r113-201ENSMUST00000079035 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm3250E9Q1M3 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms