Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms