Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cfap58B2RW38 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms