Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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