Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms