Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

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Length 176 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.75
Tmem238A9JSM3 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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