Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC12□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC12□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
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H2-M5A7VMS3 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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H2-M5A7VMS3 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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H2-M5A7VMS3 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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H2-M5A7VMS3 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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H2-M5A7VMS3 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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