Protein–RNA interactions for Protein: A2AGU5

Cldn34d, Claudin 34D, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34dA2AGU5 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn34dA2AGU5 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn34dA2AGU5 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn34dA2AGU5 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn34dA2AGU5 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn34dA2AGU5 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn34dA2AGU5 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn34dA2AGU5 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn34dA2AGU5 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn34dA2AGU5 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn34dA2AGU5 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn34dA2AGU5 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn34dA2AGU5 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn34dA2AGU5 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn34dA2AGU5 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn34dA2AGU5 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn34dA2AGU5 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn34dA2AGU5 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn34dA2AGU5 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn34dA2AGU5 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn34dA2AGU5 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn34dA2AGU5 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn34dA2AGU5 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn34dA2AGU5 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn34dA2AGU5 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn34dA2AGU5 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn34dA2AGU5 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn34dA2AGU5 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn34dA2AGU5 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn34dA2AGU5 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn34dA2AGU5 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn34dA2AGU5 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn34dA2AGU5 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn34dA2AGU5 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn34dA2AGU5 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn34dA2AGU5 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn34dA2AGU5 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn34dA2AGU5 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn34dA2AGU5 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn34dA2AGU5 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn34dA2AGU5 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn34dA2AGU5 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn34dA2AGU5 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn34dA2AGU5 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn34dA2AGU5 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn34dA2AGU5 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn34dA2AGU5 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn34dA2AGU5 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn34dA2AGU5 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn34dA2AGU5 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms