Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L1

Chd5, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd5A2A8L1 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chd5A2A8L1 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chd5A2A8L1 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chd5A2A8L1 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chd5A2A8L1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chd5A2A8L1 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chd5A2A8L1 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chd5A2A8L1 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chd5A2A8L1 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chd5A2A8L1 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chd5A2A8L1 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chd5A2A8L1 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chd5A2A8L1 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chd5A2A8L1 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chd5A2A8L1 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chd5A2A8L1 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chd5A2A8L1 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Chd5A2A8L1 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chd5A2A8L1 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chd5A2A8L1 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chd5A2A8L1 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chd5A2A8L1 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Chd5A2A8L1 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Chd5A2A8L1 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Chd5A2A8L1 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Chd5A2A8L1 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chd5A2A8L1 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Chd5A2A8L1 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Chd5A2A8L1 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chd5A2A8L1 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chd5A2A8L1 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chd5A2A8L1 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chd5A2A8L1 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chd5A2A8L1 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chd5A2A8L1 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chd5A2A8L1 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chd5A2A8L1 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chd5A2A8L1 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chd5A2A8L1 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chd5A2A8L1 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chd5A2A8L1 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chd5A2A8L1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chd5A2A8L1 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chd5A2A8L1 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chd5A2A8L1 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Chd5A2A8L1 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chd5A2A8L1 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chd5A2A8L1 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Chd5A2A8L1 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chd5A2A8L1 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chd5A2A8L1 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chd5A2A8L1 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chd5A2A8L1 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chd5A2A8L1 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chd5A2A8L1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chd5A2A8L1 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chd5A2A8L1 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chd5A2A8L1 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chd5A2A8L1 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chd5A2A8L1 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chd5A2A8L1 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chd5A2A8L1 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chd5A2A8L1 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Chd5A2A8L1 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chd5A2A8L1 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chd5A2A8L1 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chd5A2A8L1 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chd5A2A8L1 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chd5A2A8L1 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chd5A2A8L1 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chd5A2A8L1 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chd5A2A8L1 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chd5A2A8L1 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chd5A2A8L1 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chd5A2A8L1 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chd5A2A8L1 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chd5A2A8L1 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chd5A2A8L1 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chd5A2A8L1 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chd5A2A8L1 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chd5A2A8L1 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chd5A2A8L1 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chd5A2A8L1 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chd5A2A8L1 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chd5A2A8L1 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chd5A2A8L1 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chd5A2A8L1 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chd5A2A8L1 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Chd5A2A8L1 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chd5A2A8L1 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chd5A2A8L1 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chd5A2A8L1 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chd5A2A8L1 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chd5A2A8L1 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chd5A2A8L1 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chd5A2A8L1 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chd5A2A8L1 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chd5A2A8L1 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chd5A2A8L1 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chd5A2A8L1 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms