Protein–RNA interactions for Protein: V9GXR0

H2-Bl, Histocompatibility 2, blastocyst, mousemouse

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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H2-BlV9GXR0 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
H2-BlV9GXR0 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
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H2-BlV9GXR0 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
H2-BlV9GXR0 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
H2-BlV9GXR0 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
H2-BlV9GXR0 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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H2-BlV9GXR0 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
H2-BlV9GXR0 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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H2-BlV9GXR0 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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H2-BlV9GXR0 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-BlV9GXR0 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-BlV9GXR0 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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