Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Z3

Skp2, S-phase kinase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp2Q9Z0Z3 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Skp2Q9Z0Z3 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Skp2Q9Z0Z3 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Skp2Q9Z0Z3 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Skp2Q9Z0Z3 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Skp2Q9Z0Z3 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Skp2Q9Z0Z3 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Skp2Q9Z0Z3 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Skp2Q9Z0Z3 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Skp2Q9Z0Z3 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Skp2Q9Z0Z3 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Skp2Q9Z0Z3 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Skp2Q9Z0Z3 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Skp2Q9Z0Z3 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Skp2Q9Z0Z3 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Skp2Q9Z0Z3 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Skp2Q9Z0Z3 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Skp2Q9Z0Z3 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Skp2Q9Z0Z3 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Skp2Q9Z0Z3 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Skp2Q9Z0Z3 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Skp2Q9Z0Z3 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Skp2Q9Z0Z3 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Skp2Q9Z0Z3 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Skp2Q9Z0Z3 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Skp2Q9Z0Z3 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Skp2Q9Z0Z3 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Skp2Q9Z0Z3 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Skp2Q9Z0Z3 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Skp2Q9Z0Z3 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Skp2Q9Z0Z3 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Skp2Q9Z0Z3 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Skp2Q9Z0Z3 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Skp2Q9Z0Z3 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Skp2Q9Z0Z3 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Skp2Q9Z0Z3 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Skp2Q9Z0Z3 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Skp2Q9Z0Z3 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Skp2Q9Z0Z3 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Skp2Q9Z0Z3 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Skp2Q9Z0Z3 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Skp2Q9Z0Z3 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Skp2Q9Z0Z3 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Skp2Q9Z0Z3 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Skp2Q9Z0Z3 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Skp2Q9Z0Z3 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Skp2Q9Z0Z3 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Skp2Q9Z0Z3 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Skp2Q9Z0Z3 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Skp2Q9Z0Z3 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Skp2Q9Z0Z3 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Skp2Q9Z0Z3 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Skp2Q9Z0Z3 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Skp2Q9Z0Z3 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Skp2Q9Z0Z3 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Skp2Q9Z0Z3 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Skp2Q9Z0Z3 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Skp2Q9Z0Z3 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Skp2Q9Z0Z3 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Skp2Q9Z0Z3 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Skp2Q9Z0Z3 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Skp2Q9Z0Z3 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Skp2Q9Z0Z3 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Skp2Q9Z0Z3 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Skp2Q9Z0Z3 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Skp2Q9Z0Z3 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms