Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Gpc6Q9R087 Gm10701-201ENSMUST00000098926 906 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gpc6Q9R087 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
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Gpc6Q9R087 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gpc6Q9R087 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gpc6Q9R087 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gpc6Q9R087 AC154849.3-201ENSMUST00000223733 1660 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Gpc6Q9R087 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gpc6Q9R087 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gpc6Q9R087 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gpc6Q9R087 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gpc6Q9R087 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gpc6Q9R087 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gpc6Q9R087 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gpc6Q9R087 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Gpc6Q9R087 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gpc6Q9R087 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gpc6Q9R087 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gpc6Q9R087 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gpc6Q9R087 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gpc6Q9R087 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gpc6Q9R087 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gpc6Q9R087 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Gpc6Q9R087 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gpc6Q9R087 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Gpc6Q9R087 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gpc6Q9R087 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Gpc6Q9R087 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gpc6Q9R087 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gpc6Q9R087 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gpc6Q9R087 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gpc6Q9R087 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gpc6Q9R087 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gpc6Q9R087 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gpc6Q9R087 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gpc6Q9R087 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gpc6Q9R087 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gpc6Q9R087 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gpc6Q9R087 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gpc6Q9R087 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gpc6Q9R087 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gpc6Q9R087 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gpc6Q9R087 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Gpc6Q9R087 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gpc6Q9R087 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gpc6Q9R087 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gpc6Q9R087 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gpc6Q9R087 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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