Protein–RNA interactions for Protein: Q9R078

Prkab1, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkab1Q9R078 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms