Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM61

Thsd1, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 851 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thsd1Q9JM61 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Thsd1Q9JM61 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Thsd1Q9JM61 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Thsd1Q9JM61 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Thsd1Q9JM61 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Thsd1Q9JM61 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Thsd1Q9JM61 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Thsd1Q9JM61 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Thsd1Q9JM61 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Thsd1Q9JM61 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Thsd1Q9JM61 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Thsd1Q9JM61 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Thsd1Q9JM61 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Thsd1Q9JM61 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Thsd1Q9JM61 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Thsd1Q9JM61 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Thsd1Q9JM61 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Thsd1Q9JM61 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Thsd1Q9JM61 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Thsd1Q9JM61 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Thsd1Q9JM61 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Thsd1Q9JM61 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Thsd1Q9JM61 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Thsd1Q9JM61 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Thsd1Q9JM61 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Thsd1Q9JM61 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Thsd1Q9JM61 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Thsd1Q9JM61 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thsd1Q9JM61 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thsd1Q9JM61 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thsd1Q9JM61 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thsd1Q9JM61 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thsd1Q9JM61 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thsd1Q9JM61 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thsd1Q9JM61 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thsd1Q9JM61 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Thsd1Q9JM61 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thsd1Q9JM61 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thsd1Q9JM61 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thsd1Q9JM61 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thsd1Q9JM61 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Thsd1Q9JM61 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thsd1Q9JM61 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thsd1Q9JM61 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thsd1Q9JM61 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thsd1Q9JM61 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thsd1Q9JM61 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thsd1Q9JM61 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thsd1Q9JM61 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Thsd1Q9JM61 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thsd1Q9JM61 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thsd1Q9JM61 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thsd1Q9JM61 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thsd1Q9JM61 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thsd1Q9JM61 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Thsd1Q9JM61 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thsd1Q9JM61 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thsd1Q9JM61 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thsd1Q9JM61 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thsd1Q9JM61 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thsd1Q9JM61 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thsd1Q9JM61 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thsd1Q9JM61 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thsd1Q9JM61 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thsd1Q9JM61 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thsd1Q9JM61 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thsd1Q9JM61 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thsd1Q9JM61 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thsd1Q9JM61 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thsd1Q9JM61 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thsd1Q9JM61 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Thsd1Q9JM61 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thsd1Q9JM61 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thsd1Q9JM61 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thsd1Q9JM61 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thsd1Q9JM61 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thsd1Q9JM61 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thsd1Q9JM61 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thsd1Q9JM61 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Thsd1Q9JM61 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thsd1Q9JM61 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Thsd1Q9JM61 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Thsd1Q9JM61 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Thsd1Q9JM61 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Thsd1Q9JM61 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thsd1Q9JM61 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thsd1Q9JM61 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thsd1Q9JM61 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thsd1Q9JM61 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thsd1Q9JM61 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thsd1Q9JM61 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thsd1Q9JM61 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thsd1Q9JM61 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thsd1Q9JM61 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thsd1Q9JM61 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thsd1Q9JM61 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thsd1Q9JM61 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thsd1Q9JM61 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thsd1Q9JM61 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thsd1Q9JM61 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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