Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nectin3Q9JLB9 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nectin3Q9JLB9 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nectin3Q9JLB9 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nectin3Q9JLB9 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nectin3Q9JLB9 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nectin3Q9JLB9 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nectin3Q9JLB9 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nectin3Q9JLB9 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nectin3Q9JLB9 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nectin3Q9JLB9 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nectin3Q9JLB9 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nectin3Q9JLB9 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nectin3Q9JLB9 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nectin3Q9JLB9 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nectin3Q9JLB9 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nectin3Q9JLB9 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nectin3Q9JLB9 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nectin3Q9JLB9 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nectin3Q9JLB9 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nectin3Q9JLB9 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nectin3Q9JLB9 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nectin3Q9JLB9 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nectin3Q9JLB9 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nectin3Q9JLB9 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nectin3Q9JLB9 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nectin3Q9JLB9 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nectin3Q9JLB9 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nectin3Q9JLB9 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nectin3Q9JLB9 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nectin3Q9JLB9 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Nectin3Q9JLB9 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Nectin3Q9JLB9 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nectin3Q9JLB9 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nectin3Q9JLB9 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Nectin3Q9JLB9 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nectin3Q9JLB9 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nectin3Q9JLB9 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nectin3Q9JLB9 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nectin3Q9JLB9 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nectin3Q9JLB9 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nectin3Q9JLB9 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nectin3Q9JLB9 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nectin3Q9JLB9 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nectin3Q9JLB9 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nectin3Q9JLB9 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nectin3Q9JLB9 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nectin3Q9JLB9 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nectin3Q9JLB9 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nectin3Q9JLB9 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nectin3Q9JLB9 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nectin3Q9JLB9 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nectin3Q9JLB9 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nectin3Q9JLB9 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nectin3Q9JLB9 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nectin3Q9JLB9 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nectin3Q9JLB9 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nectin3Q9JLB9 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nectin3Q9JLB9 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nectin3Q9JLB9 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nectin3Q9JLB9 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Nectin3Q9JLB9 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Nectin3Q9JLB9 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nectin3Q9JLB9 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nectin3Q9JLB9 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nectin3Q9JLB9 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nectin3Q9JLB9 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nectin3Q9JLB9 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nectin3Q9JLB9 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nectin3Q9JLB9 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nectin3Q9JLB9 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Nectin3Q9JLB9 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nectin3Q9JLB9 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nectin3Q9JLB9 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nectin3Q9JLB9 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nectin3Q9JLB9 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nectin3Q9JLB9 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nectin3Q9JLB9 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nectin3Q9JLB9 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nectin3Q9JLB9 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nectin3Q9JLB9 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nectin3Q9JLB9 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nectin3Q9JLB9 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nectin3Q9JLB9 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nectin3Q9JLB9 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nectin3Q9JLB9 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nectin3Q9JLB9 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nectin3Q9JLB9 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nectin3Q9JLB9 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nectin3Q9JLB9 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nectin3Q9JLB9 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nectin3Q9JLB9 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nectin3Q9JLB9 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nectin3Q9JLB9 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nectin3Q9JLB9 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nectin3Q9JLB9 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nectin3Q9JLB9 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nectin3Q9JLB9 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nectin3Q9JLB9 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nectin3Q9JLB9 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms