Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

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Length 287 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Upk3aQ9JKX8 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Upk3aQ9JKX8 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Upk3aQ9JKX8 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Upk3aQ9JKX8 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Upk3aQ9JKX8 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Upk3aQ9JKX8 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Upk3aQ9JKX8 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Upk3aQ9JKX8 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Upk3aQ9JKX8 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Upk3aQ9JKX8 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Upk3aQ9JKX8 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Upk3aQ9JKX8 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Upk3aQ9JKX8 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Upk3aQ9JKX8 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Upk3aQ9JKX8 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Upk3aQ9JKX8 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Upk3aQ9JKX8 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Upk3aQ9JKX8 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Upk3aQ9JKX8 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Upk3aQ9JKX8 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Upk3aQ9JKX8 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Upk3aQ9JKX8 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Upk3aQ9JKX8 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Upk3aQ9JKX8 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Upk3aQ9JKX8 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Upk3aQ9JKX8 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Upk3aQ9JKX8 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Upk3aQ9JKX8 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Upk3aQ9JKX8 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Upk3aQ9JKX8 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Upk3aQ9JKX8 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Upk3aQ9JKX8 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Upk3aQ9JKX8 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Upk3aQ9JKX8 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Upk3aQ9JKX8 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Upk3aQ9JKX8 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Upk3aQ9JKX8 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Upk3aQ9JKX8 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Upk3aQ9JKX8 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Upk3aQ9JKX8 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Upk3aQ9JKX8 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Upk3aQ9JKX8 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Upk3aQ9JKX8 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Upk3aQ9JKX8 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Upk3aQ9JKX8 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Upk3aQ9JKX8 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Upk3aQ9JKX8 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Upk3aQ9JKX8 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Upk3aQ9JKX8 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Upk3aQ9JKX8 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Upk3aQ9JKX8 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Upk3aQ9JKX8 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Upk3aQ9JKX8 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Upk3aQ9JKX8 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Upk3aQ9JKX8 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Upk3aQ9JKX8 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Upk3aQ9JKX8 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Upk3aQ9JKX8 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Upk3aQ9JKX8 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Upk3aQ9JKX8 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Upk3aQ9JKX8 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Upk3aQ9JKX8 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Upk3aQ9JKX8 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Upk3aQ9JKX8 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Upk3aQ9JKX8 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Upk3aQ9JKX8 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Upk3aQ9JKX8 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Upk3aQ9JKX8 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Upk3aQ9JKX8 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Upk3aQ9JKX8 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Upk3aQ9JKX8 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Upk3aQ9JKX8 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Upk3aQ9JKX8 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Upk3aQ9JKX8 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Upk3aQ9JKX8 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Upk3aQ9JKX8 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Upk3aQ9JKX8 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Upk3aQ9JKX8 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Upk3aQ9JKX8 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Upk3aQ9JKX8 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Upk3aQ9JKX8 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Upk3aQ9JKX8 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Upk3aQ9JKX8 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Upk3aQ9JKX8 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Upk3aQ9JKX8 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Upk3aQ9JKX8 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Upk3aQ9JKX8 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Upk3aQ9JKX8 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Upk3aQ9JKX8 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Upk3aQ9JKX8 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Upk3aQ9JKX8 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Upk3aQ9JKX8 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Upk3aQ9JKX8 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Upk3aQ9JKX8 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Upk3aQ9JKX8 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Upk3aQ9JKX8 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Upk3aQ9JKX8 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Upk3aQ9JKX8 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Upk3aQ9JKX8 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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