Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

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Length 129 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Chrac1Q9JKP8 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Chrac1Q9JKP8 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Chrac1Q9JKP8 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Chrac1Q9JKP8 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Chrac1Q9JKP8 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Chrac1Q9JKP8 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Chrac1Q9JKP8 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Chrac1Q9JKP8 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Chrac1Q9JKP8 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Chrac1Q9JKP8 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Chrac1Q9JKP8 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Chrac1Q9JKP8 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Chrac1Q9JKP8 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Chrac1Q9JKP8 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Chrac1Q9JKP8 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Chrac1Q9JKP8 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Chrac1Q9JKP8 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Chrac1Q9JKP8 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Chrac1Q9JKP8 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Chrac1Q9JKP8 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Chrac1Q9JKP8 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Chrac1Q9JKP8 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Chrac1Q9JKP8 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Chrac1Q9JKP8 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Chrac1Q9JKP8 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Chrac1Q9JKP8 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Chrac1Q9JKP8 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Chrac1Q9JKP8 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Chrac1Q9JKP8 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Chrac1Q9JKP8 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Chrac1Q9JKP8 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Chrac1Q9JKP8 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Chrac1Q9JKP8 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Chrac1Q9JKP8 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Chrac1Q9JKP8 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Chrac1Q9JKP8 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Chrac1Q9JKP8 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Chrac1Q9JKP8 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Chrac1Q9JKP8 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Chrac1Q9JKP8 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Chrac1Q9JKP8 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Chrac1Q9JKP8 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Chrac1Q9JKP8 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Chrac1Q9JKP8 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Chrac1Q9JKP8 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Chrac1Q9JKP8 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Chrac1Q9JKP8 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Chrac1Q9JKP8 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Chrac1Q9JKP8 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Chrac1Q9JKP8 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Chrac1Q9JKP8 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Chrac1Q9JKP8 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Chrac1Q9JKP8 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Chrac1Q9JKP8 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Chrac1Q9JKP8 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Chrac1Q9JKP8 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Chrac1Q9JKP8 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Chrac1Q9JKP8 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Chrac1Q9JKP8 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Chrac1Q9JKP8 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Chrac1Q9JKP8 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Chrac1Q9JKP8 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Chrac1Q9JKP8 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Chrac1Q9JKP8 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Chrac1Q9JKP8 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Chrac1Q9JKP8 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Chrac1Q9JKP8 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Chrac1Q9JKP8 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Chrac1Q9JKP8 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Chrac1Q9JKP8 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Chrac1Q9JKP8 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Chrac1Q9JKP8 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Chrac1Q9JKP8 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Chrac1Q9JKP8 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Chrac1Q9JKP8 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Chrac1Q9JKP8 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Chrac1Q9JKP8 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Chrac1Q9JKP8 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Chrac1Q9JKP8 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Chrac1Q9JKP8 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Chrac1Q9JKP8 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Chrac1Q9JKP8 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Chrac1Q9JKP8 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Chrac1Q9JKP8 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
Chrac1Q9JKP8 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Chrac1Q9JKP8 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Chrac1Q9JKP8 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Chrac1Q9JKP8 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Chrac1Q9JKP8 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Chrac1Q9JKP8 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Chrac1Q9JKP8 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Chrac1Q9JKP8 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Chrac1Q9JKP8 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Chrac1Q9JKP8 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Chrac1Q9JKP8 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Chrac1Q9JKP8 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Chrac1Q9JKP8 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Chrac1Q9JKP8 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Chrac1Q9JKP8 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 174.6 ms