Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS0

Scube2, Signal peptide, CUB and EGF-like domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 997 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scube2Q9JJS0 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scube2Q9JJS0 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scube2Q9JJS0 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scube2Q9JJS0 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scube2Q9JJS0 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scube2Q9JJS0 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scube2Q9JJS0 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scube2Q9JJS0 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scube2Q9JJS0 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scube2Q9JJS0 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scube2Q9JJS0 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scube2Q9JJS0 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scube2Q9JJS0 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scube2Q9JJS0 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scube2Q9JJS0 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scube2Q9JJS0 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scube2Q9JJS0 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scube2Q9JJS0 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scube2Q9JJS0 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scube2Q9JJS0 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scube2Q9JJS0 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scube2Q9JJS0 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scube2Q9JJS0 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scube2Q9JJS0 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scube2Q9JJS0 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scube2Q9JJS0 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scube2Q9JJS0 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scube2Q9JJS0 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scube2Q9JJS0 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Scube2Q9JJS0 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scube2Q9JJS0 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scube2Q9JJS0 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scube2Q9JJS0 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scube2Q9JJS0 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scube2Q9JJS0 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scube2Q9JJS0 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scube2Q9JJS0 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scube2Q9JJS0 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scube2Q9JJS0 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scube2Q9JJS0 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scube2Q9JJS0 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scube2Q9JJS0 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scube2Q9JJS0 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scube2Q9JJS0 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scube2Q9JJS0 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Scube2Q9JJS0 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Scube2Q9JJS0 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Scube2Q9JJS0 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Scube2Q9JJS0 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Scube2Q9JJS0 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Scube2Q9JJS0 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 Gm14542-201ENSMUST00000118460 1248 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 AC154828.2-201ENSMUST00000220908 1070 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms