Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmbr1Q9JIT0 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms