Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Med27Q9DB40 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Med27Q9DB40 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Med27Q9DB40 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Med27Q9DB40 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Med27Q9DB40 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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