Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAL0

Smim23, Small integral membrane protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim23Q9DAL0 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim23Q9DAL0 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim23Q9DAL0 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim23Q9DAL0 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim23Q9DAL0 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim23Q9DAL0 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim23Q9DAL0 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim23Q9DAL0 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim23Q9DAL0 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim23Q9DAL0 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim23Q9DAL0 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim23Q9DAL0 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim23Q9DAL0 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim23Q9DAL0 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim23Q9DAL0 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim23Q9DAL0 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim23Q9DAL0 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim23Q9DAL0 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim23Q9DAL0 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim23Q9DAL0 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim23Q9DAL0 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim23Q9DAL0 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim23Q9DAL0 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim23Q9DAL0 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim23Q9DAL0 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim23Q9DAL0 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim23Q9DAL0 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim23Q9DAL0 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim23Q9DAL0 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim23Q9DAL0 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim23Q9DAL0 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim23Q9DAL0 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim23Q9DAL0 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim23Q9DAL0 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim23Q9DAL0 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim23Q9DAL0 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim23Q9DAL0 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim23Q9DAL0 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim23Q9DAL0 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim23Q9DAL0 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim23Q9DAL0 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim23Q9DAL0 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim23Q9DAL0 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim23Q9DAL0 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim23Q9DAL0 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim23Q9DAL0 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim23Q9DAL0 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim23Q9DAL0 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smim23Q9DAL0 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smim23Q9DAL0 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smim23Q9DAL0 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smim23Q9DAL0 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smim23Q9DAL0 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smim23Q9DAL0 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smim23Q9DAL0 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smim23Q9DAL0 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smim23Q9DAL0 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smim23Q9DAL0 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smim23Q9DAL0 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smim23Q9DAL0 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smim23Q9DAL0 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smim23Q9DAL0 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smim23Q9DAL0 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smim23Q9DAL0 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smim23Q9DAL0 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smim23Q9DAL0 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smim23Q9DAL0 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smim23Q9DAL0 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smim23Q9DAL0 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smim23Q9DAL0 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Smim23Q9DAL0 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Smim23Q9DAL0 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smim23Q9DAL0 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smim23Q9DAL0 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smim23Q9DAL0 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smim23Q9DAL0 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smim23Q9DAL0 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smim23Q9DAL0 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smim23Q9DAL0 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smim23Q9DAL0 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Smim23Q9DAL0 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smim23Q9DAL0 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smim23Q9DAL0 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smim23Q9DAL0 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Smim23Q9DAL0 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Smim23Q9DAL0 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Smim23Q9DAL0 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Smim23Q9DAL0 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Smim23Q9DAL0 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smim23Q9DAL0 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smim23Q9DAL0 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smim23Q9DAL0 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smim23Q9DAL0 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smim23Q9DAL0 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smim23Q9DAL0 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smim23Q9DAL0 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smim23Q9DAL0 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smim23Q9DAL0 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smim23Q9DAL0 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smim23Q9DAL0 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms