Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8K3

Derl3, Derlin-3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl3Q9D8K3 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Derl3Q9D8K3 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms