Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms