Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc7Q9D541 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc7Q9D541 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc7Q9D541 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc7Q9D541 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc7Q9D541 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc7Q9D541 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc7Q9D541 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc7Q9D541 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc7Q9D541 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc7Q9D541 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc7Q9D541 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc7Q9D541 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc7Q9D541 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc7Q9D541 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc7Q9D541 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc7Q9D541 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc7Q9D541 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc7Q9D541 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc7Q9D541 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc7Q9D541 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc7Q9D541 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc7Q9D541 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc7Q9D541 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc7Q9D541 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc7Q9D541 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc7Q9D541 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc7Q9D541 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc7Q9D541 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc7Q9D541 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms