Protein–RNA interactions for Protein: Q9D479

Uvssa, UV-stimulated scaffold protein A, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UvssaQ9D479 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UvssaQ9D479 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UvssaQ9D479 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UvssaQ9D479 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
UvssaQ9D479 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
UvssaQ9D479 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
UvssaQ9D479 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
UvssaQ9D479 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
UvssaQ9D479 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
UvssaQ9D479 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
UvssaQ9D479 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
UvssaQ9D479 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UvssaQ9D479 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
UvssaQ9D479 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UvssaQ9D479 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
UvssaQ9D479 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UvssaQ9D479 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
UvssaQ9D479 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UvssaQ9D479 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UvssaQ9D479 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
UvssaQ9D479 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UvssaQ9D479 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UvssaQ9D479 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UvssaQ9D479 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UvssaQ9D479 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UvssaQ9D479 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UvssaQ9D479 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UvssaQ9D479 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UvssaQ9D479 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UvssaQ9D479 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UvssaQ9D479 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UvssaQ9D479 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UvssaQ9D479 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UvssaQ9D479 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UvssaQ9D479 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UvssaQ9D479 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UvssaQ9D479 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UvssaQ9D479 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UvssaQ9D479 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UvssaQ9D479 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UvssaQ9D479 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UvssaQ9D479 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
UvssaQ9D479 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UvssaQ9D479 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UvssaQ9D479 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UvssaQ9D479 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UvssaQ9D479 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UvssaQ9D479 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UvssaQ9D479 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UvssaQ9D479 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
UvssaQ9D479 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UvssaQ9D479 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UvssaQ9D479 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UvssaQ9D479 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
UvssaQ9D479 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UvssaQ9D479 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UvssaQ9D479 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UvssaQ9D479 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UvssaQ9D479 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
UvssaQ9D479 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UvssaQ9D479 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UvssaQ9D479 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UvssaQ9D479 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UvssaQ9D479 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UvssaQ9D479 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UvssaQ9D479 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UvssaQ9D479 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UvssaQ9D479 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UvssaQ9D479 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UvssaQ9D479 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UvssaQ9D479 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UvssaQ9D479 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UvssaQ9D479 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UvssaQ9D479 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UvssaQ9D479 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UvssaQ9D479 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UvssaQ9D479 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
UvssaQ9D479 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UvssaQ9D479 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UvssaQ9D479 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UvssaQ9D479 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
UvssaQ9D479 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
UvssaQ9D479 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
UvssaQ9D479 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UvssaQ9D479 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UvssaQ9D479 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
UvssaQ9D479 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UvssaQ9D479 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UvssaQ9D479 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UvssaQ9D479 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UvssaQ9D479 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UvssaQ9D479 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UvssaQ9D479 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UvssaQ9D479 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UvssaQ9D479 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UvssaQ9D479 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UvssaQ9D479 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UvssaQ9D479 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UvssaQ9D479 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UvssaQ9D479 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms