Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms