Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3D0

Ttpal, Alpha-tocopherol transfer protein-like, mousemouse

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtpalQ9D3D0 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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TtpalQ9D3D0 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TtpalQ9D3D0 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TtpalQ9D3D0 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TtpalQ9D3D0 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TtpalQ9D3D0 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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TtpalQ9D3D0 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TtpalQ9D3D0 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TtpalQ9D3D0 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
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TtpalQ9D3D0 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TtpalQ9D3D0 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TtpalQ9D3D0 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
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TtpalQ9D3D0 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TtpalQ9D3D0 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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TtpalQ9D3D0 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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TtpalQ9D3D0 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TtpalQ9D3D0 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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TtpalQ9D3D0 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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TtpalQ9D3D0 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TtpalQ9D3D0 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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TtpalQ9D3D0 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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TtpalQ9D3D0 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TtpalQ9D3D0 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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TtpalQ9D3D0 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TtpalQ9D3D0 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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TtpalQ9D3D0 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TtpalQ9D3D0 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TtpalQ9D3D0 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TtpalQ9D3D0 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TtpalQ9D3D0 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TtpalQ9D3D0 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TtpalQ9D3D0 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TtpalQ9D3D0 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TtpalQ9D3D0 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TtpalQ9D3D0 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TtpalQ9D3D0 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TtpalQ9D3D0 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TtpalQ9D3D0 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TtpalQ9D3D0 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TtpalQ9D3D0 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TtpalQ9D3D0 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms