Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE7

Tmed5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed5Q9CXE7 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Tmed5Q9CXE7 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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