Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM2

Cdca4, Cell division cycle-associated protein 4, mousemouse

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca4Q9CWM2 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cdca4Q9CWM2 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cdca4Q9CWM2 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cdca4Q9CWM2 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cdca4Q9CWM2 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cdca4Q9CWM2 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cdca4Q9CWM2 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Cdca4Q9CWM2 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cdca4Q9CWM2 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cdca4Q9CWM2 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cdca4Q9CWM2 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cdca4Q9CWM2 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cdca4Q9CWM2 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cdca4Q9CWM2 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cdca4Q9CWM2 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cdca4Q9CWM2 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cdca4Q9CWM2 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cdca4Q9CWM2 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cdca4Q9CWM2 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Cdca4Q9CWM2 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cdca4Q9CWM2 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cdca4Q9CWM2 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Cdca4Q9CWM2 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cdca4Q9CWM2 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Cdca4Q9CWM2 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cdca4Q9CWM2 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cdca4Q9CWM2 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cdca4Q9CWM2 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cdca4Q9CWM2 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cdca4Q9CWM2 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cdca4Q9CWM2 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Cdca4Q9CWM2 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cdca4Q9CWM2 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cdca4Q9CWM2 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cdca4Q9CWM2 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cdca4Q9CWM2 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cdca4Q9CWM2 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cdca4Q9CWM2 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cdca4Q9CWM2 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cdca4Q9CWM2 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cdca4Q9CWM2 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cdca4Q9CWM2 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cdca4Q9CWM2 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cdca4Q9CWM2 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cdca4Q9CWM2 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cdca4Q9CWM2 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cdca4Q9CWM2 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cdca4Q9CWM2 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdca4Q9CWM2 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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