Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSV6

Sft2d3, Vesicle transport protein SFT2C, mousemouse

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Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d3Q9CSV6 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sft2d3Q9CSV6 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sft2d3Q9CSV6 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sft2d3Q9CSV6 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sft2d3Q9CSV6 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sft2d3Q9CSV6 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sft2d3Q9CSV6 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sft2d3Q9CSV6 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sft2d3Q9CSV6 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sft2d3Q9CSV6 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sft2d3Q9CSV6 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sft2d3Q9CSV6 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sft2d3Q9CSV6 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sft2d3Q9CSV6 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sft2d3Q9CSV6 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sft2d3Q9CSV6 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sft2d3Q9CSV6 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sft2d3Q9CSV6 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sft2d3Q9CSV6 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sft2d3Q9CSV6 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sft2d3Q9CSV6 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sft2d3Q9CSV6 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sft2d3Q9CSV6 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sft2d3Q9CSV6 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sft2d3Q9CSV6 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sft2d3Q9CSV6 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sft2d3Q9CSV6 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sft2d3Q9CSV6 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sft2d3Q9CSV6 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sft2d3Q9CSV6 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sft2d3Q9CSV6 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sft2d3Q9CSV6 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sft2d3Q9CSV6 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sft2d3Q9CSV6 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sft2d3Q9CSV6 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sft2d3Q9CSV6 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sft2d3Q9CSV6 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sft2d3Q9CSV6 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sft2d3Q9CSV6 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sft2d3Q9CSV6 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sft2d3Q9CSV6 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sft2d3Q9CSV6 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sft2d3Q9CSV6 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sft2d3Q9CSV6 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sft2d3Q9CSV6 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sft2d3Q9CSV6 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sft2d3Q9CSV6 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sft2d3Q9CSV6 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Sft2d3Q9CSV6 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sft2d3Q9CSV6 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sft2d3Q9CSV6 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Sft2d3Q9CSV6 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sft2d3Q9CSV6 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Sft2d3Q9CSV6 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sft2d3Q9CSV6 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sft2d3Q9CSV6 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sft2d3Q9CSV6 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sft2d3Q9CSV6 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sft2d3Q9CSV6 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sft2d3Q9CSV6 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sft2d3Q9CSV6 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sft2d3Q9CSV6 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sft2d3Q9CSV6 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sft2d3Q9CSV6 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sft2d3Q9CSV6 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sft2d3Q9CSV6 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Sft2d3Q9CSV6 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sft2d3Q9CSV6 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sft2d3Q9CSV6 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sft2d3Q9CSV6 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sft2d3Q9CSV6 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sft2d3Q9CSV6 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sft2d3Q9CSV6 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sft2d3Q9CSV6 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sft2d3Q9CSV6 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sft2d3Q9CSV6 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sft2d3Q9CSV6 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sft2d3Q9CSV6 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sft2d3Q9CSV6 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sft2d3Q9CSV6 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Sft2d3Q9CSV6 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sft2d3Q9CSV6 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sft2d3Q9CSV6 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sft2d3Q9CSV6 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sft2d3Q9CSV6 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sft2d3Q9CSV6 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sft2d3Q9CSV6 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sft2d3Q9CSV6 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sft2d3Q9CSV6 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sft2d3Q9CSV6 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sft2d3Q9CSV6 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sft2d3Q9CSV6 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sft2d3Q9CSV6 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sft2d3Q9CSV6 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sft2d3Q9CSV6 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Sft2d3Q9CSV6 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Sft2d3Q9CSV6 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sft2d3Q9CSV6 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sft2d3Q9CSV6 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Sft2d3Q9CSV6 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
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