Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW9

Ifitm3, Interferon-induced transmembrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm3Q9CQW9 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ifitm3Q9CQW9 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ifitm3Q9CQW9 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ifitm3Q9CQW9 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ifitm3Q9CQW9 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ifitm3Q9CQW9 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ifitm3Q9CQW9 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ifitm3Q9CQW9 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ifitm3Q9CQW9 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Ifitm3Q9CQW9 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ifitm3Q9CQW9 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ifitm3Q9CQW9 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ifitm3Q9CQW9 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ifitm3Q9CQW9 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ifitm3Q9CQW9 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ifitm3Q9CQW9 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ifitm3Q9CQW9 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Ifitm3Q9CQW9 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ifitm3Q9CQW9 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ifitm3Q9CQW9 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ifitm3Q9CQW9 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ifitm3Q9CQW9 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ifitm3Q9CQW9 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ifitm3Q9CQW9 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ifitm3Q9CQW9 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Ifitm3Q9CQW9 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ifitm3Q9CQW9 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ifitm3Q9CQW9 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ifitm3Q9CQW9 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ifitm3Q9CQW9 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ifitm3Q9CQW9 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ifitm3Q9CQW9 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ifitm3Q9CQW9 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Ifitm3Q9CQW9 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ifitm3Q9CQW9 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ifitm3Q9CQW9 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ifitm3Q9CQW9 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ifitm3Q9CQW9 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ifitm3Q9CQW9 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ifitm3Q9CQW9 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ifitm3Q9CQW9 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ifitm3Q9CQW9 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ifitm3Q9CQW9 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ifitm3Q9CQW9 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ifitm3Q9CQW9 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ifitm3Q9CQW9 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ifitm3Q9CQW9 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ifitm3Q9CQW9 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ifitm3Q9CQW9 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ifitm3Q9CQW9 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ifitm3Q9CQW9 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Ifitm3Q9CQW9 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ifitm3Q9CQW9 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ifitm3Q9CQW9 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ifitm3Q9CQW9 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ifitm3Q9CQW9 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ifitm3Q9CQW9 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ifitm3Q9CQW9 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ifitm3Q9CQW9 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ifitm3Q9CQW9 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ifitm3Q9CQW9 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ifitm3Q9CQW9 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ifitm3Q9CQW9 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ifitm3Q9CQW9 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ifitm3Q9CQW9 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ifitm3Q9CQW9 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Ifitm3Q9CQW9 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ifitm3Q9CQW9 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ifitm3Q9CQW9 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ifitm3Q9CQW9 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ifitm3Q9CQW9 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ifitm3Q9CQW9 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ifitm3Q9CQW9 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Ifitm3Q9CQW9 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ifitm3Q9CQW9 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ifitm3Q9CQW9 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ifitm3Q9CQW9 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ifitm3Q9CQW9 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ifitm3Q9CQW9 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ifitm3Q9CQW9 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ifitm3Q9CQW9 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ifitm3Q9CQW9 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ifitm3Q9CQW9 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ifitm3Q9CQW9 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ifitm3Q9CQW9 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Ifitm3Q9CQW9 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ifitm3Q9CQW9 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ifitm3Q9CQW9 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ifitm3Q9CQW9 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ifitm3Q9CQW9 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ifitm3Q9CQW9 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ifitm3Q9CQW9 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ifitm3Q9CQW9 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ifitm3Q9CQW9 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ifitm3Q9CQW9 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ifitm3Q9CQW9 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ifitm3Q9CQW9 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ifitm3Q9CQW9 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ifitm3Q9CQW9 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ifitm3Q9CQW9 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms