Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms