Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP3

Chchd5, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd5Q9CQP3 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chchd5Q9CQP3 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chchd5Q9CQP3 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chchd5Q9CQP3 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chchd5Q9CQP3 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chchd5Q9CQP3 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chchd5Q9CQP3 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chchd5Q9CQP3 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chchd5Q9CQP3 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chchd5Q9CQP3 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chchd5Q9CQP3 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chchd5Q9CQP3 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chchd5Q9CQP3 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chchd5Q9CQP3 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chchd5Q9CQP3 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chchd5Q9CQP3 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chchd5Q9CQP3 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chchd5Q9CQP3 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chchd5Q9CQP3 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chchd5Q9CQP3 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chchd5Q9CQP3 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chchd5Q9CQP3 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chchd5Q9CQP3 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chchd5Q9CQP3 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chchd5Q9CQP3 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chchd5Q9CQP3 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chchd5Q9CQP3 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Chchd5Q9CQP3 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Chchd5Q9CQP3 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chchd5Q9CQP3 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chchd5Q9CQP3 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chchd5Q9CQP3 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Chchd5Q9CQP3 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Chchd5Q9CQP3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chchd5Q9CQP3 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chchd5Q9CQP3 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chchd5Q9CQP3 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Chchd5Q9CQP3 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chchd5Q9CQP3 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chchd5Q9CQP3 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chchd5Q9CQP3 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chchd5Q9CQP3 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chchd5Q9CQP3 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chchd5Q9CQP3 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chchd5Q9CQP3 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chchd5Q9CQP3 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chchd5Q9CQP3 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chchd5Q9CQP3 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chchd5Q9CQP3 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chchd5Q9CQP3 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Chchd5Q9CQP3 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chchd5Q9CQP3 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Chchd5Q9CQP3 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chchd5Q9CQP3 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chchd5Q9CQP3 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chchd5Q9CQP3 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chchd5Q9CQP3 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chchd5Q9CQP3 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chchd5Q9CQP3 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chchd5Q9CQP3 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chchd5Q9CQP3 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chchd5Q9CQP3 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chchd5Q9CQP3 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chchd5Q9CQP3 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chchd5Q9CQP3 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chchd5Q9CQP3 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chchd5Q9CQP3 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chchd5Q9CQP3 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chchd5Q9CQP3 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chchd5Q9CQP3 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chchd5Q9CQP3 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chchd5Q9CQP3 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chchd5Q9CQP3 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chchd5Q9CQP3 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chchd5Q9CQP3 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chchd5Q9CQP3 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chchd5Q9CQP3 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chchd5Q9CQP3 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chchd5Q9CQP3 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chchd5Q9CQP3 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chchd5Q9CQP3 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chchd5Q9CQP3 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chchd5Q9CQP3 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chchd5Q9CQP3 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chchd5Q9CQP3 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chchd5Q9CQP3 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chchd5Q9CQP3 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chchd5Q9CQP3 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chchd5Q9CQP3 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chchd5Q9CQP3 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chchd5Q9CQP3 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chchd5Q9CQP3 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chchd5Q9CQP3 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Chchd5Q9CQP3 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chchd5Q9CQP3 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chchd5Q9CQP3 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chchd5Q9CQP3 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chchd5Q9CQP3 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chchd5Q9CQP3 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chchd5Q9CQP3 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.8 ms