Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CQC3 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CQC3 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CQC3 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CQC3 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CQC3 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CQC3 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CQC3 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
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