Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA6

Chchd1, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd1Q9CQA6 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Chchd1Q9CQA6 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Chchd1Q9CQA6 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Chchd1Q9CQA6 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Chchd1Q9CQA6 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Chchd1Q9CQA6 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Chchd1Q9CQA6 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Chchd1Q9CQA6 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Chchd1Q9CQA6 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Chchd1Q9CQA6 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Chchd1Q9CQA6 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Chchd1Q9CQA6 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Chchd1Q9CQA6 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Chchd1Q9CQA6 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Chchd1Q9CQA6 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Chchd1Q9CQA6 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Chchd1Q9CQA6 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Chchd1Q9CQA6 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms