Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms