Protein–RNA interactions for Protein: Q99LZ3

Gins4, DNA replication complex GINS protein SLD5, mousemouse

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins4Q99LZ3 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gins4Q99LZ3 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gins4Q99LZ3 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gins4Q99LZ3 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gins4Q99LZ3 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gins4Q99LZ3 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gins4Q99LZ3 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gins4Q99LZ3 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gins4Q99LZ3 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gins4Q99LZ3 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gins4Q99LZ3 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gins4Q99LZ3 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gins4Q99LZ3 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gins4Q99LZ3 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gins4Q99LZ3 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gins4Q99LZ3 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gins4Q99LZ3 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gins4Q99LZ3 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gins4Q99LZ3 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gins4Q99LZ3 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gins4Q99LZ3 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gins4Q99LZ3 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gins4Q99LZ3 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gins4Q99LZ3 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gins4Q99LZ3 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gins4Q99LZ3 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gins4Q99LZ3 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gins4Q99LZ3 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gins4Q99LZ3 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gins4Q99LZ3 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gins4Q99LZ3 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gins4Q99LZ3 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gins4Q99LZ3 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gins4Q99LZ3 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gins4Q99LZ3 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gins4Q99LZ3 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gins4Q99LZ3 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gins4Q99LZ3 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gins4Q99LZ3 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gins4Q99LZ3 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gins4Q99LZ3 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gins4Q99LZ3 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gins4Q99LZ3 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gins4Q99LZ3 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gins4Q99LZ3 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gins4Q99LZ3 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gins4Q99LZ3 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gins4Q99LZ3 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gins4Q99LZ3 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gins4Q99LZ3 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gins4Q99LZ3 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gins4Q99LZ3 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gins4Q99LZ3 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gins4Q99LZ3 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gins4Q99LZ3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gins4Q99LZ3 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gins4Q99LZ3 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gins4Q99LZ3 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gins4Q99LZ3 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gins4Q99LZ3 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gins4Q99LZ3 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gins4Q99LZ3 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gins4Q99LZ3 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gins4Q99LZ3 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gins4Q99LZ3 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gins4Q99LZ3 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gins4Q99LZ3 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gins4Q99LZ3 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gins4Q99LZ3 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gins4Q99LZ3 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gins4Q99LZ3 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gins4Q99LZ3 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gins4Q99LZ3 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gins4Q99LZ3 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gins4Q99LZ3 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gins4Q99LZ3 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gins4Q99LZ3 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gins4Q99LZ3 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gins4Q99LZ3 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gins4Q99LZ3 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gins4Q99LZ3 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gins4Q99LZ3 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gins4Q99LZ3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gins4Q99LZ3 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gins4Q99LZ3 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gins4Q99LZ3 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gins4Q99LZ3 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gins4Q99LZ3 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gins4Q99LZ3 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gins4Q99LZ3 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gins4Q99LZ3 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gins4Q99LZ3 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gins4Q99LZ3 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gins4Q99LZ3 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gins4Q99LZ3 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gins4Q99LZ3 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gins4Q99LZ3 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gins4Q99LZ3 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gins4Q99LZ3 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gins4Q99LZ3 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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