Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

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Length 76 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
SptssbQ925E8 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
SptssbQ925E8 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
SptssbQ925E8 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
SptssbQ925E8 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
SptssbQ925E8 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC7.97□□□□□ -1.13
SptssbQ925E8 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
SptssbQ925E8 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
SptssbQ925E8 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
SptssbQ925E8 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
SptssbQ925E8 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
SptssbQ925E8 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
SptssbQ925E8 Nav2-204ENSMUST00000183659 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
SptssbQ925E8 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
SptssbQ925E8 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
SptssbQ925E8 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC7.96□□□□□ -1.13
SptssbQ925E8 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
SptssbQ925E8 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
SptssbQ925E8 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
SptssbQ925E8 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
SptssbQ925E8 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
SptssbQ925E8 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
SptssbQ925E8 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
SptssbQ925E8 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.13
SptssbQ925E8 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
SptssbQ925E8 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC7.96□□□□□ -1.13
SptssbQ925E8 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
SptssbQ925E8 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
SptssbQ925E8 Vwa5b1-201ENSMUST00000030533 7486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
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SptssbQ925E8 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Trp73-205ENSMUST00000133533 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Trpm2-203ENSMUST00000105401 7274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Gm45140-202ENSMUST00000204419 5061 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Rbfox2-203ENSMUST00000166610 6573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
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SptssbQ925E8 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Zmynd8-221ENSMUST00000177633 5093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Fubp1-202ENSMUST00000166984 6523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Hivep1-201ENSMUST00000060148 8753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Dopey2-201ENSMUST00000045004 7319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
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