Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms