Protein–RNA interactions for Protein: Q91WC0

Setd3, Histone-lysine N-methyltransferase setd3, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd3Q91WC0 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms