Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms