Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms