Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms