Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms